Folding dengan Mac OS X

**dux** · 26-06-2008 00:14

Untuk membaca cerita lengkapnya seputar Folding@Home ini, baca dari situs Stanford University disini.

Konsep teknisnya adalah bahwa Folding@home ini adalah Distributed Computing (DC) dan bukan Massive Parallel Processing (MPP). Jadi beban kerja dipecah kedalam unit2 kecil yang disebut Work Unit (WU) dan dikerjakan secara OFF-LINE oleh client pada komputer user. Client inilah yang bertugas mengatur dan mengendalikan core yang merupakan program komputasi yang akan mengerjakan WU yang diberikan oleh server DC, dan akan mengirimkan kembali hasil pekerjaan itu kembali.

Berhubung sebagian besar pengguna Mac OS X di forum ini menggunakan prosessor Intel dan multicore, maka pada posting kali yang dibahas secara rinci adalah tentang Client GUI SMP nya.

Username dan Instalasi Client

Sebelum melangkah pada proses instalasi client, daftarkan diri anda dulu untuk memperoleh ID atau username yang akan dipergunakan. Halaman pendaftaran ini sama dengan halaman Download client di situs Stanford University, yaitu:

http://folding.stanford.edu/English/Download

Sebagai panduan awal pemilihan username, baca dulu thead official CHIP Asia Folding Community ini.

http://forum.chip.co.id/chip-folding-fellow/4159-join-chip-asia-folding-home-community.html

Saat ini, karakter yang tidak diperkenankan untuk dipakai dalam username adalah: # ^ ~ |. #. Dari webpage Stanford Univerity tadi, lihat apakan usernama yang ingin anda pergunakan belum digunakan oleh user lain dengan memasukkan username pada input box yang tersedia dan tekan tombol search. Apabila tidak ada orang lain yang mempergunakan username termaksud, anda bebas memakainya.

Setelah username sudah anda dapatkan, sekarang saatnya untuk menginstalasi clientnya. Halaman web pada situs download diatas akan secara otomatis akan menunjukkan client yang direkomendasikan untuk mesin kita. Client yang direkomendasikan itu akan diberi warna merah muda pada halaman tersebut. Saat ini (26 Juni 2008) versi GUI/SMP client yang paling mutakhir adalah Mac OS X (Intel) SMP Version 6.10 beta2 yang bisa dijalankan pada versi Mac OS X 10.4.0 keatas.

Setelah kita mendownload client yang versi tersebut diatas filenya bernama FAH6.10beta2-OSX-Intel.zip, dobel klik untuk membongkar isinya yang berupa file installer bernama Folding@home.mpkg. Selanjutnya dobel klik pada file installer tersebut yang akan memandu kita sepanjang proses instalasi ini.

Pada akhir proses instalasi, installer akan menambahkan file/folder berikut pada sistem kita:

Folder bernama ~/Library/Folding@home. (Tanda ~ adalah user home folder). Folder nantinya akan berisi Work Packet dan konfigurasi sistem kita.
Sebuah aplikasi bernama Folding@home Viewer yang terletak di folder Applications. Aplikasi ini belum fungsional penuh dan tidak ada hubungannya client yang sesungguhnya.
Library/PreferencePanes/Folding@home.prefPane. File ini adalah konfigurasi System Tray yang dipergunakan oleh System Preference untuk mengendalikan client.

Untuk konfigurasi awal sistem, pergunakan System Preferences yang dapat diakses melalui menu Apple di pojok kiri atas display. Klik pada icon Folding@home dari kategori Other dibagian paling bawah. Pada dialog box yang muncul kemudian, isikan data2 username anda yang telah diperoleh dari situs Stanford University tadi.

Seteleh semua data2 tadi sudah dimasukkan, pastikan bahwa komputer anda telah terhubung ke Internet. Setelah itu tekan tombol bertuliskan Start Folding@home pada Preference Pane Folding@Home tadi. Sistem akan meminta anda untuk memasukkan password. Masukkan password anda dan tekan OK.

**dux** · 26-06-2008 00:35

Memonitor Client

Karena ini adalah kali pertama anda menjalankan client, maka belum ada Work Packet yang terdiri dari Core dan Work Unit pada komputer anda. Client akan berusaha mendownload dari server Stanford University, jadi pastikan komputer anda sekarang terhubung ke internet. Jumlah core yang dijalankan oleh client ini bisa lebih dari satu.

Pada GUI client Mac OS X ini, satu-satunya sarana indikator berkaitan dengan kegiatan yang sedang dijalankan oleh client adalah log filenya. File log dari client disimpan dalam file bernama FAHlog.txt yang terletak di ~/Library/Folding@home.

Selain membaca log yang tentunya tidak akan terupdate secara realtime setelah anda buka, ada beberapa utility bawaan Mac OS X yang dapat anda pergunakan untuk memonitor kondisi clientnya secara visual dan real-time.

Utility pertama yang penting untuk dijalankan adalah Console, aplikasi yang dipergunakan untuk melihat pesan-pesan yang dikirim oleh aplikasi dan sistem kita. Letaknya ada di Applications/Utilities. Untuk kemudahan membaca pesan2 sistem yang ada, lakukan langkah2 berikut:

Pilih Console Messages dari kelompok Log Database Queries pada sidebar sebelah kiri jendela Console.
Klik icon bertuliskan Hide Log List pada bagian kiri atas jendela Console.
Pada Search Input Box pada bagian kanan atas, ketikkan folding.client

Ini akan membuat tampilan informasi dari Console akan lebih mudah dibaca. Berikut ini contoh messages dari client yang mendownload Work Packet dan berhasil menjalankannya.

Code:

# SMP Client ##################################################################
###############################################################################

* * * * * * * * * * * *Folding@Home Client Version 6.10beta2

* * * * * * * * * * * * * http://folding.stanford.edu

###############################################################################
###############################################################################

Launch directory: /Users/nDux/Library/Folding@home
Executable: /Applications/Folding@home.app/fah6
Arguments: -smp 

[03:19:15] - Ask before connecting: No
[03:19:15] - User name: dux.ID (Team 38608)
[03:19:15] - User ID: 6E79276A1780CD60
[03:19:15] - Machine ID: 1
[03:19:15] 
[03:19:15] Loaded queue successfully.
[03:19:15] 
[03:19:15] + Processing work unit
[03:19:15] Core required: FahCore_a1.exe
[03:19:15] Core not found.
[03:19:15] - Core is not present or corrupted.
[03:19:15] - Attempting to download new core...
[03:19:15] + Downloading new core: FahCore_a1.exe
[03:19:25] + 10240 bytes downloaded
[03:19:26] + 20480 bytes downloaded
[03:19:26] + 30720 bytes downloaded
--------------- dipotong supaya ringkas ------------------
[03:22:19] + 983040 bytes downloaded
[03:22:21] + 993280 bytes downloaded
[03:22:22] + 1003520 bytes downloaded
[03:22:24] + 1013760 bytes downloaded
[03:22:24] + 1018323 bytes downloaded
[03:22:24] Verifying core Core_a1.fah...
[03:22:24] Signature is VALID
[03:22:24] 
[03:22:24] Trying to unzip core FahCore_a1.exe
[03:22:25] Decompressed FahCore_a1.exe (3246776 bytes) successfully
[03:22:25] + Core successfully engaged
[03:22:30] 
[03:22:30] + Processing work unit
[03:22:30] Core required: FahCore_a1.exe
[03:22:30] Core found.
[03:22:30] Working on Unit 01 [March 24 03:22:30]
[03:22:30] + Working ...
[03:22:30] 
[03:22:30] *------------------------------*
[03:22:30] Folding@Home Gromacs SMP Core
[03:22:30] Version 1.74 (September 24, 2007)
[03:22:30] 
[03:22:30] Preparing to commence simulation
[03:22:30] - Ensuring status. Please wait.
[03:22:30] Created dyn
[03:22:30] - Files status OK
[03:22:30] - Expanded 283572 -> 1508541 (decompressed 531.9 percent)
[03:22:30] - Starting from initial work packet
[03:22:30] 
[03:22:30] Project: 3043 (Run 0, Clone 52, Gen 56)
[03:22:30] 
[03:22:30] Assembly optimizations on if available.
[03:22:30] Entering M.D.
[03:22:47] ial work pa- Starting fro 3043 (Run 0, Clone 52, Gen 56)
[03:22:47] 
[03:22:47] Entering M.D.
[03:22:47] one 52, Gen 56)
[03:22:47] 
[03:22:47] Entering M.D.
[03:22:53] mdrunner cpfilename: 
[03:22:53] Rejecting checkpoint
[03:22:54] Protein: 9684 p3029_SMP-emsv-03
[03:22:54] xtra SSE boost OK.
[03:22:54] 
[03:22:54] Extra SSE boost OK.
[03:22:54] Writing local files
[03:22:54] Completed 0 out of 10000000 steps* (0 percent)
[03:47:24] Writing local files
[03:47:24] Completed 100000 out of 10000000 steps* (1 percent)
[04:11:26] Writing local files
[04:11:26] Completed 200000 out of 10000000 steps* (2 percent)
[04:35:53] Writing local files
[04:35:53] Completed 300000 out of 10000000 steps* (3 percent)
[05:03:26] Writing local files
[05:03:26] Completed 400000 out of 10000000 steps* (4 percent)
[05:32:13] Writing local files
[05:32:13] Completed 500000 out of 10000000 steps* (5 percent)

Utility kedua yang mungkin anda perlukan adalah Activity Monitor. Aplikasi ini dipergunakan untuk memeriksa kondisi sistem, letaknya di Applications/Utilities. Disini dapat dilihat presentasi grafis penggunaan CPU yang bisa memberikan indikasi apakah client masih berjalan baik.

Perhatikan pada gambar diatas bahwa terdapat 4 core untuk mesin dengan 1 prosesor dual core. Berarti untuk masing2 core CPU ada 2 core nya client yang aktif.

**dux** · 26-06-2008 00:41

Troubleshooting

Dari pengalaman, masih banyak kendala yang dihadapi dengan client ini. Oleh karena itu disarankan supaya secara rutin melakukan backup pada Work Data.
Buat folder bernama Backup atau apapun didalam folder kerja client (~/Library/Folding@home) dan kopikan semua data pada folder parentnya tadi ke folder ini secara berkala.

Untuk restore data dari folder Backup tadi apabila nantinya ada masalah client yang crash, lakukan langkah berikut untuk mengulang proses dari titik backup terakhir:

Hentikan client dari System Preferences. System akan meminta konfirmasi dengan password.
Restart system untuk memastikan bahwa client tidak lagi aktif.
Restore data dari folder backup tadi.
Jalankan kembali client dari System Preferences.

Untuk informasi dan bantuan apabila terdapat kendala, dapat diperoleh disini:

CHIP Folding Fellow
Folding@home Support Forum
F@H Homepage

Semoga membantu dan Selamat Melipat...

**rafael** · 26-06-2008 02:26

thread yg sangat berguna untuk Mac user... coba dari dulu bro

**dux** · 26-06-2008 16:50

Wah, akhirnya sukses juga posting ini kekirim setelah mencoba kirim mulai tadi malam...

Sebetulnya aku juga baru mulai Folding akhir Maret 2008 ini, bro. Awalnya banyak masalah, bro Redwood yang banyak bantu awalnya. Sempat juga absen lama, sebelum dikasi dorongan semangat sama 'mpu Gandrik. Juga semua rekan disini asik2 orangnya, macam bro GSB dan lainnya. Jadinya betah juga disini.

Di board Mac juga aku pernah posting, tapi berhubung kayaknya tidak banyak yang tertarik, jadi gak ada yang balas sama sekali... Tapi sekarang kayaknya aku tau cara membuat mereka tertarik folding. Kita racunin aja yuk pake GRP....

**dux** · 26-06-2008 23:25

[Tip dan Trik]

Selalu Lakukan Restart Setelah Menghentikan Client !

Penting untuk diingat bahwa client beta ini masih belum stabil, jadi SELALU lakukan restart pada sistem anda setelah karena sesuatu hal anda perlu menghentikan client. Apabila anda tidak melakukan restart, ada kemungkinan core masih aktif dan client akan mendownload WU baru dari server.
Kalau hal ini terjadi, maka konfigurasi client anda akan direset. WU yang nantinya akan dikirim pada kondisi ini akan dihitung sebagai anonymous dan tidak masuk dalam perhitungan poin kumulatif anda.
Anda akan benar2 folding untuk humanity.

Ini terjadi lagi sore ini di clientku.

Untuk memeriksa apakah status user ID pada sistem masih seperti yang anda inginkan, cek pada System Preferences pada pane Folding@home. Apabila user ID tetap, baru anda tekan tombol untuk start client.
Cara lain untuk memeriksa adalah dengan melihat file MyFolding.html yang terletak di folder ~/Library/Folding@home. Apabila link yang ada pada bagian statistik merujuk pada username Anonymous, anda perlu memperbaiki status client anda. Lihat contoh cuplikan isi file MyFolding.html dibawah ini:

Code:

Statistics
Personal statistics: http://fah-web.stanford.edu/cgi-bin/main.py?qtype=userpage&username=Anonymous&teamnum=0
Team statistics: http://fah-web.stanford.edu/cgi-bin/main.py?qtype=teampage&teamnum=0

Cara untuk membenahi sebagai berikut:

Hentikan client dari System Preferences
Lakukan restart sistem
Buka Pane Folding@home dari System Preferences
Isi username yang benar
Start client
Pastikan pada log / Console ditampilkan username anda.

Perubahan ini penting dilakukan pada saat mengirimkan WU yang selesai. Apabila terjadi pada pertengahan proses pengerjaan WU, tidak masalah, selama anda sempat untuk menggantinya dan merestart client sebelum mengirim WU tersebut.

Semoga membantu.

**g4ndr1k** · 27-06-2008 01:41

Manstappppppp

Suatu saat nanti kalau aku punya Macintel (sekarang G5 & G4 semua) aku pasti akan coba

**rafael** · 22-07-2008 16:50

mantep memang folding pake Macintosh/Hackintosh

1%-nya WU smp client bisa selesai dalam waktu 8 menit

**garo** · 22-07-2008 16:58

tapi ko d gw pake cpu usagenya smpe 100% trus ya bro??
gw da coba yg 6.10b2 sama 6.02 (console),,, sama2 gitu

**rafael** · 22-07-2008 17:10

Originally Posted by garo

tapi ko d gw pake cpu usagenya smpe 100% trus ya bro??
gw da coba yg 6.10b2 sama 6.02 (console),,, sama2 gitu

pake cpu apa bro? ini contoh di Activity Monitor gw :

kalo nge-liat stats dari Team MacOS X bener-bener bikin ngiler...
ppd dari top 20 producers diatas 6000-an semua ..

Welcome to the CHIP Forum.

Thread: Folding dengan Mac OS X

Tweet

Thread Tools

Display